Tout payer ou pas?

bonsoir tous le monde, j'ai besoin de vos lumieres.
nous avons fait faire notre maçonnerie par un artisan local. le montant global des travaux maconnerie, terrassement , vrd s'éleve à 46 000€
il nous reste la derniere facture a payer 3500€ mais des petits soucis sont apparus.je m'explique
*non respect des réservations pour couler la dalle au rdc.
on a du remonter la porte d'entrée(possible car enduit pas encore posé au moment des faits), découper de montants central des baies pour que ça coulisse sinon ça s'ouvrait pas, on a pas pu couler la chape dans la buanderie car la réservation est insuffisnte pour mettre le plancher chauffant(il faut 3cm au dessus des tuyaux)
*tous les seuils de portes et de baies sont fissurés(maçonnerie achevée fin 2008)
*planéité de la 1ere dalle non respectée. on a du acheter plus d'isolant de sol que prévu, pour rectifié les écarts dans la dalle, avant de mettre la plancher chauffant au rdc. (et un peu plus le chapiste voulait pas couler la dalle)environ 3 cm d'écarts à différents endroits de la maison(la maison fait que 14m de long). et la dalle de l'étage c encore pire elle est nue pour le moment mais y a au pire 4 cm de différence entre différents point de l'étage...

donc es ce que je dois régler en totalité cette derniere facture? ou es ce que je peux faire une retenue?

j'aurai bien été tentée de retenir 5% du montant global soit 2300€ et donc de lui verser seulement 1200€ sur les 3500€ restants, mais suis-je dans mon droit...?
sinon c'était du beau boulot qd m... alors que dois-je faire?

(je precise que nous étions notre maitre d'oeuvre)

merci d'avance pour vos reponses