Rouille toiture ardoise

Bonjour à tous,
voici mon souci : 

J'ai acheté il y a un an et demi une maison qui date de 2004.
Comparé aux maisons voisines les ardoises semblent plus épaissent, 4 mm environ (plus robustes?) et moins lisses. Bref, elles me semblaient pas mal.
Il y avait dessus pas mal de mousses par rapport à mes voisins. Sans doute l'aspect irrégulier, des ardoises a t elle fait que par rapport aux autres maisons ayant le même âge (le lotissement date de 2004) a fait que les mousses et lichen se sont plus développés.

Bref, j'ai fait venir un couvreur qui a mis un produit il y a un an et malgré l'été sec, les pluies de cet hiver on fait partir les mousses.

Mais voilà... je vois depuis des traces de ce qui semble être de la rouille, et donc de la pyrite. Traces que je ne voyais pas avant!
Je ne pense pas que le produit de démoussage ai détérioré la toiture. je ne pense pas non plus que ces traces soient apparues juste ces derniers mois après 15 ans de vie de la maison. 
je me dit que sans doute , les lichen devaient cacher ces traces.

Le constat est donc que j'ai de multiples petites traces (plus au Sud qu'au Nord). Quand je regarde de près et que je gratte, cela ne semble pas être si fragile. Il faut que je gratte un peu fort pour que cela parte. Et cela reste superficiel. Je me dit donc que si cela dure depuis 15 ans, même avec un aspect peu esthétique, le côté superficiel semble laisser penser que mes ardoises ne vont pas percer dans les 5/10 ans.

Je n'ai clairement pas la somme pour refaire la couverture (j'imagine 10 à 15 000 euros pour mes 200m2... et encore...)

J'aurais donc voulu avoir l'avis d'un spécialiste... qui ne viendra pas avant la fin du confinement... Donc si ici il y a des connaisseurs, je suis preneur.
J'ai lu ici et là qu'il y avait deux types de pyrite. la superficielle et la traversante. 

Donc : 

- un traitement anti mousse (non agressif pour la nature et fait par un couvreur pro qui a pignon sur rue) a-t-il pu détériorer mes ardoises et les faire rouiller?

- Si c'est présent depuis le début (15 ans), pensez vous que, vu que cela semble superficiel, cela puisse n'être qu'esthétique?

- Selon vos connaissances, quelles seraient le coût fourniture et main d'oeuvre, de la réfection pour 200m2?

- Existe-t-il des traitements de protection qui ralentirait ce processus?

Je m'excuse par avance si ma question semble bête.