Justificatifs apports personnel pour PTZ : émission avant signature de l'offre

Bonjour,
Je m'excuse d'avance pour ce pavé, mais je préfère bien expliquer la situation.
Nous avons rencontré plusieurs problèmes lors de la création de notre dossier d'emprunt PTZ et signature de l'offre (entre la simulation du prêt et la signature finale s'est écoulée quand même 9 mois).
On nous a validé notre prêt par erreur car il manquait un papier, au mois de juin 2020. 
Entre temps nous avions déjà commencé différents travaux : terrassement et fondation au mois de juillet 2020. 
A ce même moment, on nous annonce par téléphone que le service a validé par erreur ce prêt et qu'il cherche à rectifier l'erreur .... cela a pris 4 mois avant que le problème soit résolu et que notre emprunt soit enfin validé.
Problématique : nous avions déjà prévu des travaux avec les entreprises, nous avons bien versé les sommes avec preuve de facture mais la date étant antérieure à l'édition de l'offre, cela ne passe pas dans notre justificatif d'apport.
Pour 4 mois d'attente suite à cette erreur (pis vacances du conseiller aussi tiens).
Nous sommes coincés car nous ne savons pas comment justifier aujourd'hui le montant manquant, le changement de date sur ces factures serait donc "usage de faux" même si la facture et règlement existent bien ? 
Merci d'avance de vos réponses,
Cdt
SaraJles