Probleme permis de construire de 12 mois

Bonjour,
J’ai fait déposer par mon maitre d’œuvre une demande de permis de construire qui, selon les usages, aurait impliqué une réponse dans un délai de 2 mois.
Je viens de recevoir une lettre de la mairie de la commune concernée m’informant que la demande de permis de construire ne rentre pas dans ce cadre.
Cette lettre stipule que je dois attendre 12 mois du fait de la spécificité du site «en site classé » et si, à l’issue de cette période,je n’ai pas de réponse, le permis est considéré comme non acquis.
J’ai versé 5000 euros à mon maitre d’œuvre pour la dépose du permis. Quelle est la démarche pour annuler ma demande de permis et récupérer une partie de mon dépôt, si bien sûr cela est possible.