Litige charpente : DTU ? Et : accepter des bricolages pour corriger les malfaçons ?

Bonjour,

J'ai un litige avec un charpentier suite à la rénovation complète de la toiture d'une maison en pierres : rehausse ossature bois sur chaînage béton armé, bardage bois en façade, pannes, chevrons, voliges, fibre de bois en sarking, fibre de bois pare pluie, littelage, couverture.
ça dure depuis des années, et on ne s'en sort pas...

Parmi les malfaçons :
  - défaut de contreventement (rehausse, baie vitrée de 5m de large...), partiellement rattrapé (sur notre suggestion) par la pose d'OSB à l'intérieur
  - section des pannes trop faible (limite de rupture en cas de forte neige)
  - absence de pare-vapeur en toiture
  - isolant fibre de bois non caissonné et accessible => les rongeurs qui infestaient la maison avant rénovation, s'installent à nouveau...
  - absence de grille anti rongeurs sous le bardage (le bardage ne va pas jusqu'au sol, il s'arrête à 2m de hauteur)
  - etc.

La plupart des malfaçons ont fait l'objet de réserves à la réception des travaux. Sauf la section des pannes (on ne sait pas calculer ce genre de choses...).
L'expert judiciaire a reconnu la plupart des gros soucis, mais préconise systématiquement des bricolages pour les corriger. Cela nous semble très injuste. L'indemnité proposée est de quelques milliers d'€, alors que le charpentier consulté pour reprendre les travaux en conservant au maximum les matériaux, nous a fait un devis d'un montant supérieur au montant des 1ers travaux (soit > 50k€...)

Exemples : 
  - pannes trop faibles ? Pas de contreventement ? Pas de soucis, il suffit de rajouter des jambes de force (dont une passerait au milieu de la SdB)
  - absence de pare-vapeur ? Pas de soucis, si ça condense, la fibre de bois sèche très bien.
  - dégât des eaux pendant le chantier ? Pas de soucis, la fibre de bois sèche très bien.
  - absence de grille anti-rongeurs ? Pas de soucis, il suffit de faire une entaille à la disqueuse dans le mur en pierre sous le bardage, tout le tour de la maison, et d'y insérer des grilles métalliques (à 2m de hauteur, je le rappelle)

Je n'ai pas les DTU, même après avoir consulté un charpentier, je n'ai pas de certitudes sur ce qui est dans la DTU ou "simplement" dans les règles de l'art : pare-vapeur, isolant caissonné, grille anti-rongeurs...

Merci d'avance pour vos conseils avisés !