Ancien ou neuf ? Notaire et TVA ?

Bonjour à tou(te)s,
après avoir lu de nombreuses infos utiles sur le forum, j'ai à mon tour besoin de vos avis et conseils.

Ma femme et moi devrions signer un compromis pour l'achat d'un logement la semaine prochaine.
J'ai de nombreuses interrogations sur les taxes afférentes à ce projet. En effet, ce logement dans une copro de 6 a été accepté pour un usage d'habitation suite à permis de construire (tout comme 2 autres logements qui étaient des garages avant, le notre était un atelier collé aux garages). Il y a tout à faire, seuls le toit, les murs extérieurs et les le plancher existent et sont bons. Nous passons par un architecte qui fera la maîtrise d'oeuvre.
Le règlement de copro fourni par le notaire mentionne que c'est "un plateau brut à usage d'habitation à aménager".

Le notaire annonce des frais de 8.2% = rénovation de l'ancien et donc taxé au maximum.
Les travaux vont cependant concerner plus des 2/3 des 6 éléments de second oeuvre donc = considéré comme neuf et donc taxé au maximum (TVA 20%).

Ainsi, j'ai l'impression d'être dans une situation incohérente. Je risque de me trouver taxé 2 fois au maximum : une fois parce que c'est considéré comme de l'ancien par le notaire, et une fois parce que c'est considéré comme du neuf par la législation (TVA à 20% appliquée par les artisans car je ne peux par fournir le CERFA 13948).

Quels seraient vos conseils ? (demander aux notaires les frais du neuf ? demander aux artisans la TVA réduite au risque de me prendre un redressement fiscal ...?)

Je ne dois pas être le premier dans ce cas vu le nombre d'atelier qui sont transformés en appart' ou lofts.

Merci d'avance