Calcul du délai de construction

Bonjour à toutes et à tous.
Nous avons entrepris la construction d'une maison bbc à toit plat. Permis accepté en août 2013, le chantier démarre le 21 novembre 2013 par la pose des chaises puis le 27 par le décapage et les fondations.....partielles et arrêtées aussitôt car la nature du terrain laisse perplexe, le terrassier et le maçon souhaitent une étude de sol. A noter que j'ai porté en mairie la déclaration d'ouverture de chantier en date du 27.11.2013.
Ladite étude de sol avait été évoquée avant signature avec le maitre d'œuvre, qui la jugeait inutile...Bref.   Etude faite, semelles consolidées moyennant un surplus financier de + de 20000euros, discutions animées multiples, devis modifiés, maçon changé entre temps... les travaux ont repris le 3/03/2014 , pour s'achever le 23/02/2015.
Dans le contrat de maitrise d'œuvre, concernant le délai des travaux , il est stipulé qu'ils commencent au mieux en octobre 2013 pour s'achever au plus tard fin octobre 2014, jugeant 11 mois de travaux nécessaires. Au contrat , pénalités de 23 euros journaliers par jours de retard...
Refusant de régler une partie des honoraires du maitre d'œuvre , celui ci me menace de les lui devoir au prétexte que les travaux ont réellement commencé en mars 2014.... ( si ceux ci ont dépassé les délais annoncés, c'est quand même par négligence du MO , non?)
Ma déclaration d'ouverture de chantier ne compte plus dans ce cas?
Merci de m'apporter vos réponses éclairées.