Démarches après refus permis de construire

Bonjour à tous,

La mairie de la ville dans laquelle nous souhaitons constuire notre maison vient de nous notifier un refus de permis de construire.
Nous sommes très dépités et craignons pour la suite de notre dossier.

Les raisons invoquées sont : un faîtage non conforme car pas réalisé dans le sens de la plus grande longueur de la maison ; un remblai prévu par le constructeur et non autorisé car zone inondable et donc pb pour l'écolulement des eaux ; et pour finir un puis perdus qui aurait dû être clairement indiqué dans nos plans et que le constructeur n'a pas indiqué.

Notre constructeur nous rassure en nous indiquant que ces demandes sont faciles à corriger et que si la mairie n'avait pas été aussi pointilleuse, le permis aurait été accordé avec ces recommandations. Qu'en pensez vous ?

Les délais d'instruction du nouveau permis de construire seront-ils équivalents ou moins long (compte tenu du fait que le dossier a déjà été examiné) ?

La correction de ces non-conformités permet-elle d'obtenir "automatiquement" gain de cause ?

Merci de vos retours d'expériences, car nous sommes un peu découragés par cette situation.