Avenant en plus value après étude de sol.

Bonjour à tous,
Je reviens vers vous pour solliciter vos conseils. Nous avons acheté une parcelle de terrain dans un lotissement et avons trouvé notre CST. Nous avons signé notre CCMI le 14 juin 2012 . Dans le contrat était stiplué une provision de 4000 euros (au résultat de l'étude de sol). Nous savons très bien que cette étude aurait dû être faite en amont, mais le CST nous a dit qu'avec eux c'était comme ça, il provisionnait. L'étude de sol a été réalisée le 26 juin dernier soit une dizaine de jours après la signature du CCMI. Il en résulte un premier avenant de 3500 euros pour fondation spéciale(donc il reste 500 euros sur les 4000 provisionnés, du plus nous dit tout content le CST). Nous savons que tout cela est abusif et illégal, mais nous souhaitions faire le projet avec ce CST; La loi étant de notre côté, nous pensons qu'à la fin du chantier nous réclamerons avec les dates des signatures du CCMI et de l'étude de sol, le remboursement des 3500 euros. Est-ce que quelqu'un a déjà été dans notre cas? Avant de signer cet avenant avec "bon pour accord", nous attendons vos expériences et vos conseils , nous allons faire inscrire à côté de la date et de la signature " Sous réserve de nos droits".
Merci pour vos réponses