Obligation légale pour Architetcte et établissement permis

Bonjour,
Dans le cadre d'une SCI, je viens d'acquérir une ancienne maison pour laquelle tout est à "refaire". Cette maison comprend une partie habitation de 160 m² sur 2 niveaux ainsi que d'une dépendance de 60m² au sol avec possibilité de faire un étage de 60m². Je souhaite faire réaliser l'ensemble des travaux par un professionnel.
je comprends très bien qu'une partie des travaux sera de la rénovation (partie habitable, donc tva 10%) et l'autre partie du Neuf donc TVA 20%.
L'intégralité des travaux sera effectué par une seule entreprise qui fera Gros oeuvres, placo, électricité, plomberie, il n'y aura aucune consultation, j'ai totalement confiance en cet entrepreneur.

Ma question se situe au niveau du dépot du permis de construire, si je fais mon projet en 2 partie (partie reno dans un 1er temps et partie neuve quelques mois plus tard), est ce que je peux déposer un permis de travaux pour la 1ere partie et un permis de construire pour la seconde (sachant que pour la première partie je conserve les ouvertures existantes, peut etre une modification de fenêtre en porte fenêtre mais aucune nouvelle ouverture)

je sais que la maison en tant que telle devra changer de destination, de maison individuelle vers 3 appartements.
Dans ce cas, pensez vous qu'un architecte est obligatoire (juste pour la partie administrative, en aucun cas je souhaite un maitre d'ouvrage).
Est ce que les documents que je dois fournir aux services urbanismes compétents sont réalisables par mon entrepreneur et moi même ? si oui quelles pourraient être les possibles complications si elles existent ?

merci par avance de votre aide. Si quelqu un a connu cette situation, cela m’intéresse beaucoup de connaitre son vécu.