Sur quelle base doit se constituer un permis de construire car l'ancien est échu ?

Bonjour à tous,

Pas facile de résumer la problématique qui bloque mon projet ! J'espère être assez clair.

1. Je suis en cours d'achat d'une maison afin de la réhabiliter entièrement et y créer 3 appartements.
2. Les anciens propriétaires ont obtenu un permis de construire en avril 2012, permis échu aujourd'hui car ils n'ont pas fait de travaux durant des périodes dépassant un an.
3. Je redépose un permis de construire complet pour mon projet, en me basant sur ce qu'ils ont eu le temps de faire comme travaux (maçonnerie, toiture neuve, etc…).
4. Ils n'ont pas respecté certains éléments (2 lucarnes en toiture au lieu d'une sur le permis par exemple).
5. J'ai envoyé mon permis pour une pré-consultation avant dépôt définitif à la mairie.

6. Problématique : ils m'ont répondu qu'il fallait que je me base sur la maison existante AVANT les travaux exécutés par l'actuel propriétaire ! Donc en gros, tous les travaux qu'ils ont fait de toiture, nouveaux murs, etc... doivent apparaître comme nouveau éléments dans mon permis. 

Merci de bien vouloir me confirmer que cette remarque est une ineptie et incohérente. Ils ont validé un permis pour des travaux, qui a donné lieu à des travaux, certains n'ont pas été exécutés dans les règles, mais ce n'est vraiment pas à moi de compenser ces modifications. De plus, je n'ai strictement aucune idée de la toiture avant travaux (vieille grange), et n'achète pas le bien dans l'état de 2012...

Très bonne soirée à tous.

François