Maison non conforme règles urbanisme

Bonjour, Ma femme et moi faisons construire notre maison par un promoteur, c'est à dire plan construction jusqu'à remise des cléfs.
Ce qui ce passe c'est que je me suis rendu à la mairie pour connaître les démarches à faire pour réaliser une terrasse ainsi qu'un accès à la maison, et les problème commence là!
Pour commencer le service Urbanisme vient de se rendre compte que le garage de la maison devait soit être à 3m soit en limite de propriété, hors le mien se situe à 2,44m de la limite.
La construction n'étant pas encore achevé, j'ai pris un rdv avec le service urbanisme qui m'as informé (rdv pour la semaine prochaine) que je devrais modifié cela afin d'être en conformité, ce que je comprends car en attendant toute demande déposer (accès ou terrasse) seras automatiquement refusé.
De plus sur les plans du constructeur on vois que la terre est à fleurs de la porte, hors je n'ais pas le droit de rajouter plus que 60cm de remblais au dessus de la terre naturel, et le seuil de la porte du trouve à plus de 1,50m de la terre naturel (car je vient aussi d'apprendre récemment que ma maison était en zone inondable ce qui explique sa hauteur).
Si quelqu'un peut m'aiguiller sur les recours possibles en attendant mon rdv avec le service urbanisme.
La maison doit être livrée d'ici juillet, selon les dates.

Je sait que mon cas n'est pas désespéré, mais c'est vrai que dans ce cas là on ne sait pas vers qui se tourner, je n'ais pas encore contacter mon promoteur immobilier, avant d'être sur du recours possibles.
Dans l'attente je vous remercie.